В соответствии с законодательством Российской Федерации к компетенции Главного следственного управления Следственного комитета Российской Федерации по городу Москве относится:
-Проведение проверок сообщений и производство предварительного расследования по уголовным делам о преступлениях, готовящихся и совершенных на территории города Москвы, отнесенных в соответствии с ч. 2 ст. 151 Уголовно-процессуального кодекса Российской Федерации к подследственности следователей Следственного комитета Российской Федерации;
-Осуществление процессуального контроля деятельности подразделений Главного следственного управления Следственного комитета Российской Федерации по городу Москве;
-Разрешение жалоб на действия (бездействие) и решения должностных лиц подразделений Главного следственного управления Следственного комитета Российской Федерации по городу Москве;
-Рассмотрение обращений по вопросам коррупционных проявлений со стороны сотрудников Главного следственного управления Следственного комитета Российской Федерации по городу Москве, совершения ими проступков либо преступлений;
-Разрешение вопросов кадрового обеспечения, подбора кандидатов для замещения вакантных должностей сотрудников Главного следственного управления Следственного комитета Российской Федерации по городу Москве.